45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0205 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  100 
 
 
734 aa  1440    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  74.47 
 
 
734 aa  1016    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  34.21 
 
 
688 aa  80.5  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  26.38 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  26.5 
 
 
427 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2230  hypothetical protein  27.89 
 
 
430 aa  60.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.615453  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  28.71 
 
 
425 aa  59.7  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2206  putative integral membrane protein  26.38 
 
 
433 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0896  hypothetical protein  37.5 
 
 
656 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000365013  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2488  putative integral membrane protein  27.98 
 
 
421 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.59815  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2263  putative integral membrane protein  26.38 
 
 
438 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2217  putative integral membrane protein  26.38 
 
 
438 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  29.92 
 
 
477 aa  55.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  26.01 
 
 
410 aa  55.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  24.88 
 
 
469 aa  53.9  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4803  hypothetical protein  33.08 
 
 
623 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0267485  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  29.91 
 
 
419 aa  53.9  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3443  hypothetical protein  30.12 
 
 
655 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.047188  normal  0.0829627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  33.79 
 
 
705 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  27.24 
 
 
414 aa  52  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  27.36 
 
 
418 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  27.36 
 
 
418 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  28.18 
 
 
421 aa  50.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  28.93 
 
 
426 aa  50.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  27.5 
 
 
431 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3915  putative integral membrane protein  26.75 
 
 
417 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279766  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  25.45 
 
 
430 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  31.69 
 
 
477 aa  50.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  26.71 
 
 
420 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  23.74 
 
 
494 aa  48.5  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  26.92 
 
 
418 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1331  hypothetical protein  30.77 
 
 
751 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  25.97 
 
 
428 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  28.93 
 
 
468 aa  47.4  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  28.71 
 
 
369 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  31.25 
 
 
827 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  28.23 
 
 
395 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  27.93 
 
 
417 aa  46.6  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  27.41 
 
 
444 aa  45.8  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  27.65 
 
 
653 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5075  hypothetical protein  30.66 
 
 
574 aa  45.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2505  hypothetical protein  29.82 
 
 
768 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3209  hypothetical protein  29.25 
 
 
1143 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0782308  normal  0.555781 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0442  hypothetical protein  30.89 
 
 
826 aa  44.3  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.186794 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0753  hypothetical protein  25.82 
 
 
437 aa  44.3  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>