17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1896 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  100 
 
 		 429 aa  856    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2268  Protein of unknown function DUF2029  54.77 
 
 		 419 aa  423  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.32611  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2263  putative integral membrane protein  50.49 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2488  putative integral membrane protein  51.12 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.59815  normal  0.388539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2206  putative integral membrane protein  50.49 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2217  putative integral membrane protein  50.49 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3915  putative integral membrane protein  50.62 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.279766  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12688  integral membrane protein  50.75 
 
 		 433 aa  352  8e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.1921e-48  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  28.92 
 
 		 412 aa  53.5  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  27.27 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  21.88 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  30 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  26.85 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  23.77 
 
 		 444 aa  46.6  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  27.81 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  26.63 
 
 		 420 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  26.13 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>