60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_21600 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  100 
 
 
467 aa  900    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  41.41 
 
 
421 aa  226  9e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  32.97 
 
 
479 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  32.58 
 
 
414 aa  152  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  32.72 
 
 
444 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  33.77 
 
 
469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  34.36 
 
 
402 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  33.97 
 
 
395 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  34.45 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  34.45 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  31.39 
 
 
408 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  30.25 
 
 
425 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  33.89 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  32.61 
 
 
477 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  32.7 
 
 
420 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  34.16 
 
 
408 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  32.69 
 
 
431 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  31.82 
 
 
398 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  27.27 
 
 
420 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  31.99 
 
 
477 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  34.36 
 
 
411 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  31.73 
 
 
443 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  31.73 
 
 
443 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  30.67 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  31.73 
 
 
443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  30.67 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  30.67 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  33.33 
 
 
470 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  29.19 
 
 
417 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  29.31 
 
 
412 aa  107  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  34.84 
 
 
417 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  31.19 
 
 
369 aa  105  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  29.91 
 
 
478 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  29.67 
 
 
418 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  28.53 
 
 
428 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  29.67 
 
 
418 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  29.67 
 
 
418 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  30.22 
 
 
427 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  29.58 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  29.58 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  29.58 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  28.89 
 
 
494 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  30.64 
 
 
438 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  32.18 
 
 
378 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  30.64 
 
 
438 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  30.64 
 
 
438 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  31.17 
 
 
419 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  30.74 
 
 
430 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  29.97 
 
 
406 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  31.07 
 
 
437 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  29.8 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  31.71 
 
 
455 aa  89.7  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  31.88 
 
 
570 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  29.34 
 
 
408 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  30.03 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  30.84 
 
 
463 aa  82.8  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  28.67 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  29.66 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0649  hypothetical protein  34.17 
 
 
420 aa  58.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  30.59 
 
 
429 aa  57.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>