63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5055 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  89.57 
 
 		 477 aa  763    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  922    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  42.52 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  42.02 
 
 		 478 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  44.16 
 
 		 419 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  43.23 
 
 		 408 aa  196  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  42.68 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  34.58 
 
 		 469 aa  166  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  33.24 
 
 		 427 aa  143  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  34.44 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  34.21 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  28.96 
 
 		 428 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  35.33 
 
 		 443 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  35.33 
 
 		 443 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  35.33 
 
 		 443 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  32.89 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  33.24 
 
 		 408 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  35.69 
 
 		 421 aa  127  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  33.02 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  33.44 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  30.95 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  30.2 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  30.2 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  30.68 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.76 
 
 		 411 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  31.38 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  30.68 
 
 		 479 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 455 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  32.55 
 
 		 470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  32.51 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  36.31 
 
 		 402 aa  113  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  35.03 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  33.13 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  33.95 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  29.59 
 
 		 425 aa  111  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  31.53 
 
 		 417 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  31.68 
 
 		 398 aa  110  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  31.81 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  30.73 
 
 		 570 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  32.9 
 
 		 417 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  32.9 
 
 		 417 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  34.67 
 
 		 463 aa  103  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  32.1 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  28.73 
 
 		 494 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  29.97 
 
 		 422 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  29.97 
 
 		 422 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  29.97 
 
 		 422 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  30.28 
 
 		 420 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  30.95 
 
 		 395 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  29.89 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  31.29 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  31.29 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  31.29 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  28.48 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  28.48 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  28.48 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  33.44 
 
 		 378 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  28 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  31.56 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0753  hypothetical protein  27.71 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  29.57 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  29.1 
 
 		 734 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  26.8 
 
 		 734 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>