64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5433 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  832    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  43.86 
 
 
395 aa  269  8e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  35.85 
 
 
425 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  35.92 
 
 
414 aa  190  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  36.65 
 
 
427 aa  186  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  40.17 
 
 
378 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  37.8 
 
 
428 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  36.53 
 
 
418 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  36.53 
 
 
418 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  36.53 
 
 
418 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  36.76 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  37.76 
 
 
417 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  34.44 
 
 
444 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  36.22 
 
 
421 aa  154  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  35.24 
 
 
469 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  34.77 
 
 
398 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  37.37 
 
 
494 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  31.34 
 
 
431 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  36.51 
 
 
470 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  31.82 
 
 
408 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  33.55 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  32.38 
 
 
478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  31.74 
 
 
426 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  33.05 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  33.67 
 
 
417 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  34.71 
 
 
434 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  33.66 
 
 
443 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  33.66 
 
 
443 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  33.66 
 
 
443 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  35.22 
 
 
411 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  34.26 
 
 
570 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  32.01 
 
 
437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  30.61 
 
 
477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  31.43 
 
 
406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  30.73 
 
 
422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  30.73 
 
 
422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  30.73 
 
 
422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  31 
 
 
428 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  31 
 
 
428 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  31 
 
 
428 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  28.08 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  31.25 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  32.68 
 
 
455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  30.63 
 
 
477 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  33.11 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  26.62 
 
 
467 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  33.71 
 
 
412 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  29.87 
 
 
438 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  29.87 
 
 
438 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  29.87 
 
 
438 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  32.15 
 
 
455 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  31.38 
 
 
463 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  31.99 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  31.32 
 
 
410 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  30.05 
 
 
429 aa  94.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  32.25 
 
 
408 aa  93.6  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  29.89 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  29.89 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  29.22 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  23.87 
 
 
469 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  29.35 
 
 
468 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.103603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2387  hypothetical protein  31.03 
 
 
462 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00724191  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1896  Protein of unknown function DUF2029  26.63 
 
 
429 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73633  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  24.41 
 
 
734 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>