12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0754 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0754  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  738    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110422 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0751  hypothetical protein  32.42 
 
 		 382 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00031079  normal  0.110422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  29.63 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  29.63 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  29.63 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  25.91 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  29.86 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  29.86 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  29.86 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4408  hypothetical protein  33.7 
 
 		 90 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.181225  normal  0.661347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5286  hypothetical protein  25.64 
 
 		 431 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.32718 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  24.62 
 
 		 408 aa  42.7  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>