More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2154 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  100 
 
 
206 aa  407  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  79.39 
 
 
148 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  71.67 
 
 
132 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  70.73 
 
 
132 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  70.73 
 
 
132 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  57.89 
 
 
141 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  49.56 
 
 
128 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  46.27 
 
 
570 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  48 
 
 
267 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
130 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 
291 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
128 aa  99.4  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 
169 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  43.85 
 
 
134 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
200 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  48.44 
 
 
133 aa  92.8  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
132 aa  91.3  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  39.42 
 
 
147 aa  89.4  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
136 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.22 
 
 
135 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 
129 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
150 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 
145 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
138 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 
133 aa  84.7  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.46 
 
 
135 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 
135 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  41.54 
 
 
138 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  41.54 
 
 
138 aa  84.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.46 
 
 
135 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
126 aa  84  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  40.46 
 
 
135 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.46 
 
 
135 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 
138 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.46 
 
 
135 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  45.74 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
133 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 
142 aa  82  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  40.31 
 
 
137 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.69 
 
 
135 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  40.31 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  40.31 
 
 
137 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  39.53 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
129 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
151 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
129 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
138 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  38.17 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
130 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
133 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
130 aa  77  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.46 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  42.74 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  43.59 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.46 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.46 
 
 
138 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  43.59 
 
 
138 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.69 
 
 
138 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  43.59 
 
 
138 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  40 
 
 
129 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.46 
 
 
138 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
138 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  42.98 
 
 
144 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
135 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  40.62 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  40.62 
 
 
132 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  42.24 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  39.84 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.52 
 
 
128 aa  72  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.52 
 
 
128 aa  72  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.52 
 
 
128 aa  72  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  35.34 
 
 
136 aa  72  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
131 aa  72  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  38.4 
 
 
130 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  41.13 
 
 
128 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  33.05 
 
 
132 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  37.5 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  38.03 
 
 
383 aa  68.2  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  37.98 
 
 
347 aa  68.2  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>