More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8468 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  100 
 
 
130 aa  250  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  67.74 
 
 
128 aa  160  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  67.21 
 
 
145 aa  147  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  54.48 
 
 
144 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 
132 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 
153 aa  123  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  54.84 
 
 
200 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  52.85 
 
 
128 aa  120  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  52.71 
 
 
147 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  50.85 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 
267 aa  111  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  56.6 
 
 
570 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 
156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  48.15 
 
 
145 aa  107  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  51.56 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  50.77 
 
 
132 aa  106  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  51.26 
 
 
166 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  48.87 
 
 
153 aa  106  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  50 
 
 
169 aa  103  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  56.03 
 
 
291 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
206 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
132 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
132 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
132 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  55.14 
 
 
151 aa  100  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  47.9 
 
 
141 aa  100  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  57.14 
 
 
133 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  50.41 
 
 
124 aa  100  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  46.28 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  47.2 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  41.8 
 
 
136 aa  97.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 
137 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  43.08 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  42.06 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 
131 aa  81.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  41.41 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  37.19 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  42.64 
 
 
313 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
129 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
141 aa  77  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  41.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  41.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  40.62 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  38.46 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  35.66 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  35.29 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  35.29 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  35.66 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.22 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  36.22 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.22 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.02 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.02 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.22 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.8 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.22 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.02 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  42.64 
 
 
315 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  40.59 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  36.92 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  38.1 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  37.19 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  37.19 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  41.53 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  38.21 
 
 
318 aa  71.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  36.67 
 
 
317 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  34.71 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  41.86 
 
 
315 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.15 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  39.06 
 
 
316 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.15 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.15 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.15 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  39.23 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>