More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
133 aa  254  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  60.8 
 
 
267 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  54.69 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  56.35 
 
 
200 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  55.28 
 
 
145 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  49.22 
 
 
148 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 
206 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  55.73 
 
 
570 aa  116  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 
130 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  51.54 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  52.99 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  54.39 
 
 
169 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
132 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
132 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 
291 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
132 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 
144 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  48.46 
 
 
147 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 
167 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 
244 aa  90.5  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  44.53 
 
 
170 aa  85.5  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  40.32 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  31.2 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.67 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.67 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.67 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
134 aa  77  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  33.85 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  42.61 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  44.17 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.02 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  39.02 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  36.36 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.77 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  40.52 
 
 
318 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  36.29 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.96 
 
 
360 aa  67  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  38.84 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  32.31 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  32.31 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  36.89 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  29.77 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  37.29 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  30.65 
 
 
352 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  30.65 
 
 
352 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  33.33 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  45.79 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
187 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  37.6 
 
 
130 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.79 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  35.25 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  34.43 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  30.08 
 
 
399 aa  62  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  34.71 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  35.25 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  31.25 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>