More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0742 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  100 
 
 
169 aa  329  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  49.58 
 
 
128 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 
200 aa  111  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 
128 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  50 
 
 
132 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  50 
 
 
130 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
291 aa  101  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  48 
 
 
141 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  48.31 
 
 
124 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  46.22 
 
 
267 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  46.61 
 
 
148 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 
147 aa  95.5  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  42.86 
 
 
147 aa  95.5  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  48.74 
 
 
145 aa  95.9  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 
156 aa  94.4  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
151 aa  94  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 
153 aa  94  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
132 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  46.27 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  45.45 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  44.8 
 
 
132 aa  92  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
132 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
132 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  38.14 
 
 
132 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  54.39 
 
 
133 aa  89  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  49.12 
 
 
570 aa  88.6  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  49.55 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  44.27 
 
 
153 aa  87.4  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
130 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
130 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  37.8 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  34.85 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
138 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.59 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.59 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.59 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  36.92 
 
 
131 aa  72  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  36.92 
 
 
131 aa  72  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  36.36 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.5 
 
 
135 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
135 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  39.5 
 
 
135 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.97 
 
 
138 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
132 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.5 
 
 
135 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.5 
 
 
135 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  37.8 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.66 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.24 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.24 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  32 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  34.68 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.66 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.66 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.83 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  39.52 
 
 
312 aa  67.4  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  36.84 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  31.3 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  33.87 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  33.86 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4880  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  35.09 
 
 
399 aa  64.3  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.6 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  34.88 
 
 
317 aa  63.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  29.45 
 
 
384 aa  63.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  36 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  33.08 
 
 
142 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  38.71 
 
 
314 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  36 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>