More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2491 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  100 
 
 
138 aa  273  7e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.53 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  44.53 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.53 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.53 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.53 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.75 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.75 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.09 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.56 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  39.84 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.41 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.41 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.41 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.41 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.41 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  38.52 
 
 
315 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  36.89 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  40 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  33.6 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  55.93 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  37.3 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  55.74 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  38.14 
 
 
312 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  55.93 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
291 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
167 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  36.09 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
200 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  52.46 
 
 
142 aa  67  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  38.52 
 
 
314 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  37.21 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  37.21 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.54 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  30.4 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  30.4 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  35.38 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  39.53 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  56.14 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  56.36 
 
 
314 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  34.4 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  56.36 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  36.09 
 
 
320 aa  64.3  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  55.36 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  56.14 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  33.87 
 
 
400 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  36.09 
 
 
320 aa  63.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.88 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.88 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.88 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  50 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  34.45 
 
 
302 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  32.56 
 
 
347 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.58 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  52.73 
 
 
314 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  54.39 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  54.39 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  54.39 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  38.33 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>