More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2414 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 126 aa  261  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  50.4 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  49.6 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 		 138 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  39.34 
 
 		 363 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  40.34 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  40 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  35.48 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  39.84 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 137 aa  91.7  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  39.52 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  40.32 
 
 		 137 aa  90.5  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  40.68 
 
 		 386 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.34 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.02 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  39.52 
 
 		 132 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  37.3 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  36.59 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  37.4 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  37.1 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  35.54 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  35.54 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 138 aa  87  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.02 
 
 		 138 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 133 aa  86.7  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.29 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  36.97 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  37.98 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  34.68 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 206 aa  84  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 153 aa  84.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  39.82 
 
 		 315 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  37.61 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  38.46 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  35.94 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.21 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  39.5 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.21 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  38.94 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  38.52 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  33.88 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  37.19 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  39.13 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  37.19 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  35.25 
 
 		 352 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  39.06 
 
 		 313 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  38.79 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  32.8 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  37.19 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  32.03 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  38.79 
 
 		 314 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  35.25 
 
 		 347 aa  81.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  36.13 
 
 		 316 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  32.54 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  38.79 
 
 		 314 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  32.26 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  35.25 
 
 		 352 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  38.79 
 
 		 314 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>