More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1170 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  75.91 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  48 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  42.37 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  34.43 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.93 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  35.83 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 		 138 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  33.6 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.9 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  33.6 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.9 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.9 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.1 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  33.87 
 
 		 329 aa  73.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  33.87 
 
 		 329 aa  73.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  35.59 
 
 		 400 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  30.08 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  33.59 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  35.34 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  37.29 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  32.5 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  37.29 
 
 		 320 aa  72  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.61 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.15 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  30.77 
 
 		 352 aa  72  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.46 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  31.3 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  29.03 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.62 
 
 		 363 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  32.76 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.79 
 
 		 360 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  36.67 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  32.5 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  34.19 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  32.5 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  29.03 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  36 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  36 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  35.83 
 
 		 347 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  28.23 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  28.23 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  29.51 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 334 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  28.23 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  37.17 
 
 		 302 aa  68.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  28.23 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.33 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  35.9 
 
 		 314 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  28.24 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  29.03 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  33.06 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  34.19 
 
 		 314 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.75 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.3 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  32.23 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  34.19 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  30.4 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  34.21 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  32.23 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>