More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4263 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 147 aa  278  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  47.79 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  50.39 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  47.76 
 
 		 473 aa  97.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  57.63 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  67.39 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  50.67 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  43 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  32.39 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  32.39 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  40.86 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  46.43 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 162 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  35.59 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.03 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  53.57 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  39.19 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  35.59 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  34.95 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  35.59 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  35.59 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  49.23 
 
 		 346 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  41.57 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  49.21 
 
 		 345 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  47.95 
 
 		 345 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  35.59 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  34.35 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  36.45 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  51.61 
 
 		 346 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  49.3 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 		 346 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 		 346 aa  57  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  48.39 
 
 		 346 aa  57  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  51.85 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  48.57 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2564  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303675  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  54.72 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  54.72 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  54.72 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>