More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2381 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  100 
 
 		 139 aa  273  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  62.59 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  63.5 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  64.34 
 
 		 141 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  59.56 
 
 		 143 aa  160  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  58.96 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 		 151 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  37.67 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  40.17 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  39.55 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  39.55 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  39.55 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 236 aa  70.5  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  38.93 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  44.12 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  38.54 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  38.54 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  38.54 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  30.17 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  41.07 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  43.42 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  34.58 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 294 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  32.71 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 199 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  47.46 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  36.27 
 
 		 269 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  33.62 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  45.68 
 
 		 473 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  32.35 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1826  phosphohydrolase  35.79 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  39.55 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  38.71 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  35.29 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  38.71 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>