More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4015 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  80.88 
 
 		 138 aa  223  7e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  64.29 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  67.18 
 
 		 141 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  64.52 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  61.15 
 
 		 147 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  59.56 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 		 155 aa  105  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  47.32 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  39.13 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 158 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  40 
 
 		 158 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 158 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  40.78 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  35.04 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  43.7 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  33.98 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  37.74 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  35.29 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  35.29 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  35.29 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  45.74 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  40.96 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  44.68 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 196 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  44.68 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  44.68 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  44.68 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  37.12 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  41.67 
 
 		 570 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 199 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  42.55 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  37.88 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  37.04 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  30.58 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  41.23 
 
 		 473 aa  58.9  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  47.5 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  30.91 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  41.49 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  30.91 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  30.91 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  49.3 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  30.91 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>