More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1301 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  100 
 
 
163 aa  328  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  86.5 
 
 
158 aa  277  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  86.5 
 
 
158 aa  277  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  86.5 
 
 
158 aa  277  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 
163 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
162 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
167 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
167 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  50 
 
 
147 aa  100  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  42.98 
 
 
152 aa  90.9  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 
146 aa  90.5  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
167 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  40.17 
 
 
139 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  40 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  37.93 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  45.63 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  35.51 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3067  NUDIX hydrolase  44.85 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  36.94 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  31.16 
 
 
399 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  35.07 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
229 aa  64.7  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  39.32 
 
 
383 aa  63.9  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  35.34 
 
 
400 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.96 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
184 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  35 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
141 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
252 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  33.33 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  34.19 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  32.87 
 
 
352 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
142 aa  61.6  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  38.71 
 
 
141 aa  61.6  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
156 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  32.33 
 
 
386 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  29.79 
 
 
142 aa  61.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
179 aa  61.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  30.07 
 
 
352 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  33.33 
 
 
137 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.02 
 
 
158 aa  60.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  38.64 
 
 
195 aa  60.8  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  34.19 
 
 
149 aa  60.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  33.04 
 
 
363 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  35.04 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  35.04 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  29.37 
 
 
352 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 
252 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  35.04 
 
 
140 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  31.65 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
194 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2130  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
175 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  42.27 
 
 
226 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
305 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
198 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.34 
 
 
473 aa  58.9  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.02 
 
 
181 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  33.02 
 
 
181 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>