More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3067 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3067  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 159 aa  319  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  52.55 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  46.21 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  46.21 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  46.21 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  44.85 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  44.21 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.33 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  34.33 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.65 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  33.6 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  40.59 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 229 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  40.59 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  43.16 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  60 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  34.75 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  38.05 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  29.6 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  38.78 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  53.03 
 
 		 282 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 267 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  33.71 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.59 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  34.31 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  35.29 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  32.37 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  31.3 
 
 		 386 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  34.09 
 
 		 352 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  36.11 
 
 		 317 aa  54.3  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  39.02 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  39.02 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  30.33 
 
 		 352 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>