More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3170 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  100 
 
 
179 aa  363  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  66.9 
 
 
147 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  65.49 
 
 
147 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  65.49 
 
 
144 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  67.88 
 
 
142 aa  193  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  67.15 
 
 
142 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0229  NUDIX hydrolase  64.79 
 
 
153 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
149 aa  87  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 
141 aa  84.7  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
151 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
146 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
134 aa  72  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  31.36 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
163 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  35 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  35 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  35 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  37.39 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.38 
 
 
139 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  36.07 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
132 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
155 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
155 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
132 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
132 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
143 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  33.08 
 
 
347 aa  62.4  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
141 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
139 aa  62  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
171 aa  61.6  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  27.21 
 
 
153 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
147 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  27.21 
 
 
153 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
147 aa  61.6  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  31.19 
 
 
137 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
163 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  31.09 
 
 
142 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
147 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
147 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  32.73 
 
 
163 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  29.03 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  32.11 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  30.56 
 
 
134 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  32.11 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
133 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  31.93 
 
 
163 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
168 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  32.11 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  35 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  34.91 
 
 
473 aa  60.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
126 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
134 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  33.96 
 
 
530 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  29.32 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
137 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 
172 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
136 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
138 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  28.37 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
236 aa  59.3  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  30.63 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
132 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
137 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
158 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
140 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
147 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  32.63 
 
 
149 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
147 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
154 aa  58.2  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
148 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>