More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3208 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 168 aa  333  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  48.2 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  51.49 
 
 		 147 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 167 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 149 aa  98.6  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 138 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  40 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  42.11 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  39.05 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  37.17 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  40.88 
 
 		 473 aa  72.4  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  56.06 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  69.39 
 
 		 134 aa  67  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  34.75 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6285  cytidyltransferase-related domain protein  40.98 
 
 		 358 aa  64.7  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000881728  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  36.21 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  44.21 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3067  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 136 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 138 aa  62  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  40 
 
 		 136 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 143 aa  62  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 136 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  39.36 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  32.14 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3717  cytidyltransferase-like protein  40.5 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  36.52 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0974  cytidyltransferase-like protein  40.5 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  36.52 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  32.5 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0679  cytidyltransferase-related domain protein  37.1 
 
 		 344 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  32.43 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  39.77 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0701  cytidyltransferase-like protein  37.1 
 
 		 344 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.962082  normal  0.0273891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  32.43 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>