More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2554 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 160 aa  310  7.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  34.01 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  32.7 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  38 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  30.53 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  43.01 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  37 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  42.35 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  35.25 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  33.91 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  29.37 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  50.75 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.04 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  37.76 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  37 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5035  mutT/nudix family protein  31.91 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  40.43 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4795  mutT/nudix family protein  31.91 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  29.66 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4636  Nudix hydrolase  31.91 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  45.76 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  36.46 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  55.56 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5158  mutT/nudix family protein  31.91 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.972651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  37.74 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1682  SH3-like region  38.81 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00241886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  49.15 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  27.14 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  26.71 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4656  Nudix hydrolase  31.91 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  27.14 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  36.67 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5064  mutT/nudix family protein  30.85 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  27.86 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5063  mutT/nudix family protein  30.85 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  26.71 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  58.49 
 
 		 134 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  28.43 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 143 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  28.97 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3582  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 137 aa  51.2  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  32.79 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 199 aa  51.2  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3567  hypothetical protein  42.68 
 
 		 181 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.76977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5069  mutT/nudix family protein  40.68 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 228 aa  50.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 187 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 187 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>