More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0922 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 136 aa  258  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  38.58 
 
 		 473 aa  63.9  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  39.86 
 
 		 337 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  38.14 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  36.67 
 
 		 524 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  46.91 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  28.93 
 
 		 187 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  38.1 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  29.46 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  54.72 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  65.96 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  33.6 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  35.66 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  44.33 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  37.4 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 177 aa  53.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 221 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  34.4 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 167 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  58 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 167 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2062  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  24.64 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  37.5 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  27.35 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  53.45 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  50 
 
 		 209 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  53.57 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  42.53 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  33.03 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  53.57 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  53.57 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  36.04 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  34.86 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  34.92 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  33.64 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 142 aa  50.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  34.92 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  50.85 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1943  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.639742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  34.4 
 
 		 136 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  34.4 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  51.79 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  34.4 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  42.99 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>