More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2607 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 157 aa  307  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  91.84 
 
 		 169 aa  263  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 340 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  35.67 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  51.67 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  60.42 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  35.58 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 327 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 347 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  52.73 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  43.08 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  56.36 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  49.21 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 282 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 176 aa  51.2  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  48.1 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2721  mutT/nudix family protein  34.04 
 
 		 170 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00212915  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  50.85 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  31.67 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 		 315 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  51.67 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 441 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2500  mutT/nudix family protein  32.98 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0522279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2461  MutT/Nudix family protein  32.98 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2685  mutT/nudix family protein  32.98 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 361 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2700  mutT/nudix family protein  32.98 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000999675 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  69.44 
 
 		 361 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  46.94 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0096  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 184 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.27 
 
 		 131 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0325  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.26 
 
 		 170 aa  47.4  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2431  MutT/Nudix family protein  31.91 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000214023  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 192 aa  47.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 361 aa  47.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2751  MutT/Nudix family protein  31.91 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000576438  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  48.48 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3917  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 281 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  50.82 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 305 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  52.73 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  39.71 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2603  mutT/nudix family protein  40.3 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.0000289813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  52.73 
 
 		 347 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.27 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  32.09 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  50 
 
 		 132 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0623  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  44.78 
 
 		 351 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  50 
 
 		 132 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>