More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2445 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 169 aa  335  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  91.84 
 
 		 157 aa  263  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  50.34 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  36.91 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 340 aa  57.4  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  46.25 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  27.56 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2704  NUDIX hydrolase  25.85 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0109153 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  50.77 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 327 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  56.36 
 
 		 216 aa  52.4  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3917  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  52.46 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 193 aa  51.6  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 		 136 aa  51.6  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  49.02 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 204 aa  51.2  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 200 aa  51.2  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  47.69 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0096  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2721  mutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00212915  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 		 282 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 441 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.31 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00712308  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2631  MutT/nudix family protein  25.66 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2461  MutT/Nudix family protein  41.18 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0668  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.91 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  32.09 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 130 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2500  mutT/nudix family protein  39.71 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0522279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2685  mutT/nudix family protein  39.71 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2700  mutT/nudix family protein  39.71 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000999675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 130 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 		 315 aa  47.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  72.41 
 
 		 132 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 347 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  72.41 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2431  MutT/Nudix family protein  38.24 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000214023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  27.93 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2146  tellurite resistance protein  68.57 
 
 		 361 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  46 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 164 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2145  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.26 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  51.67 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2751  MutT/Nudix family protein  38.24 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000576438  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.19 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.19 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  31.09 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.91 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2603  mutT/nudix family protein  40.3 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.643872  hitchhiker  0.0000289813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2259  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0325  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.68 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.19 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2590  NUDIX hydrolase  27.03 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  normal  0.0536923 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0514  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.28 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.561307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 361 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2110  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.31 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.326827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  50.91 
 
 		 132 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0556  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.28 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000501582  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0820  NUDIX hydrolase  65.71 
 
 		 361 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.397397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>