296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2259 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2259  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 157 aa  327  5.0000000000000004e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  62.42 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1874  NUDIX hydrolase  57.96 
 
 		 162 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00903017  hitchhiker  0.00000719314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2477  NUDIX hydrolase  57.96 
 
 		 162 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000509657  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2590  NUDIX hydrolase  57.96 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  normal  0.0536923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2470  NUDIX hydrolase  57.96 
 
 		 162 aa  185  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000173828  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2061  MutT/nudix family protein  60.15 
 
 		 157 aa  174  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000668178  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2232  NUDIX hydrolase  56.33 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000560671  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2704  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0109153 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2631  MutT/nudix family protein  58.09 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1748  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1604  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 		 163 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1561  NUDIX hydrolase  56.72 
 
 		 149 aa  160  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1679  NUDIX hydrolase  53.95 
 
 		 163 aa  158  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.164244  normal  0.63188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2899  MutT/nudix family protein  51.88 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433775  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6013  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1613  NUDIX family hydrolase  49.24 
 
 		 148 aa  130  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2850  NUDIX family hydrolase  49.24 
 
 		 148 aa  130  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.482932 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1721  NUDIX hydrolase  49.24 
 
 		 148 aa  130  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1761  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1639  MutT/NUDIX family NTP pyrophosphohydrolase  45.14 
 
 		 151 aa  127  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1312  hydrolase, NUDIX family  46.04 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.869507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01132  bifunctional thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase/ thiamin pyrophosphate hydrolase  46.04 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01140  hypothetical protein  46.04 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2513  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00897802  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2469  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1991  NUDIX family hydrolase  46.04 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1297  NUDIX family hydrolase  46.04 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1254  NUDIX family hydrolase  46.04 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1595  hydrolase, NUDIX family  46.04 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000876504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2023  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296194  normal  0.0882034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2062  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 150 aa  124  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2131  NUDIX family hydrolase  44.6 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1943  NUDIX hydrolase  42.95 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.639742  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3803  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 175 aa  120  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.122492  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1210  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1870  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0662124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3755  NUDIX hydrolase  42.95 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4074  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.999235 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1336  NUDIX family hydrolase  43.17 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0415939 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1352  NUDIX family hydrolase  43.17 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1949  hydrolase, NUDIX family  43.17 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3425  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.70639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2155  NUDIX hydrolase  40.27 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.028212  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1314  NUDIX family hydrolase  44.62 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0388  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4725  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1841  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3293  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1647  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.654975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2244  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000175605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2968  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1920  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241342 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4549  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 194 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0784  dNTP pyrophosphohydrolase  38.41 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2558  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.475051 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0697  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1265  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1682  SH3-like region  44.2 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00241886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3567  hypothetical protein  37.86 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.76977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3595  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 148 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2114  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2724  hypothetical protein  39.58 
 
 		 168 aa  103  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1947  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00431661  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1258  NUDIX domain-containing protein  35.77 
 
 		 210 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2398  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0248094  normal  0.0729139 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1141  NUDIX domain-containing protein  35.77 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2365  NUDIX domain-containing protein  35.77 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0279  NUDIX domain-containing protein  35.77 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3395  NUDIX domain-containing protein  35.77 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3785  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2545  NUDIX family hydrolase  35.77 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3388  NUDIX family hydrolase  35.77 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3353  NUDIX family hydrolase  35.77 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1786  MutT/nudix family protein  37.09 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0690  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2443  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2822  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2959  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30160  hypothetical protein  39.39 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0666  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2582  hypothetical protein  39.39 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.287135  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0215  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1832  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.315644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2174  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0699  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0428  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4009  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  35.04 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2685  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 169 aa  97.1  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28350  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1450  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0592  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0618  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.977297  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06139  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  36.3 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01027  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  36.3 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3189  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 148 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.283215  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3357  mutT/nudix family protein  34 
 
 		 148 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0573059  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0852  putative hydrolase  32.82 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.696744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3417  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.579474 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2544  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>