194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0852 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0852  putative hydrolase  100 
 
 		 151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.696744 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2114  NUDIX hydrolase  57.64 
 
 		 147 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2365  NUDIX domain-containing protein  61.07 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3395  NUDIX domain-containing protein  61.07 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2544  NUDIX hydrolase  59.87 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0279  NUDIX domain-containing protein  61.07 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1141  NUDIX domain-containing protein  61.07 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3353  NUDIX family hydrolase  61.07 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3388  NUDIX family hydrolase  61.07 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2545  NUDIX family hydrolase  61.07 
 
 		 169 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4009  putative NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  61.07 
 
 		 159 aa  174  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0690  NUDIX hydrolase  62.25 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1258  NUDIX domain-containing protein  59.73 
 
 		 210 aa  169  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4074  NUDIX hydrolase  58.39 
 
 		 161 aa  168  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.999235 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3425  NUDIX hydrolase  58.39 
 
 		 161 aa  167  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.70639  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1210  NUDIX hydrolase  59.03 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3293  NUDIX hydrolase  55.86 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2558  NUDIX hydrolase  52.9 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.475051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2959  NUDIX hydrolase  57.53 
 
 		 183 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0388  NUDIX hydrolase  53.59 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2968  NUDIX hydrolase  52.26 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3785  NUDIX hydrolase  58.39 
 
 		 209 aa  163  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0215  NUDIX hydrolase  58.39 
 
 		 172 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0666  NUDIX hydrolase  58.39 
 
 		 172 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0699  NUDIX hydrolase  58.39 
 
 		 172 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2724  hypothetical protein  51.66 
 
 		 168 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2685  NUDIX hydrolase  58.39 
 
 		 169 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2822  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2244  NUDIX hydrolase  49.32 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000175605  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0592  NUDIX hydrolase  56.38 
 
 		 169 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164112  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0618  NUDIX hydrolase  56.38 
 
 		 169 aa  156  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.977297  normal  0.828472 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4725  NUDIX hydrolase  53.02 
 
 		 163 aa  155  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3755  NUDIX hydrolase  51.37 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6013  NUDIX hydrolase  52.35 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0428  NUDIX hydrolase  54.05 
 
 		 166 aa  150  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1832  NUDIX hydrolase  52.45 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.315644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2174  NUDIX hydrolase  52.45 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3567  hypothetical protein  53.06 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.76977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4549  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 194 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3803  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.122492  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1761  NUDIX hydrolase  48.97 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1841  NUDIX hydrolase  51.05 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3595  NUDIX hydrolase  48.61 
 
 		 148 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1450  NUDIX hydrolase  48.3 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274315 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0784  dNTP pyrophosphohydrolase  45.83 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3417  NUDIX hydrolase  49.31 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.579474 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0697  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4013  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 		 146 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.149682  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30160  hypothetical protein  46.53 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2398  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0248094  normal  0.0729139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1820  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.062894 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2582  hypothetical protein  46.53 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.287135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06139  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  49.24 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01027  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  49.24 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3189  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 148 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.283215  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3618  NUDIX hydrolase  46.53 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1920  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2899  MutT/nudix family protein  40.71 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.433775  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3357  mutT/nudix family protein  43.75 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0573059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28350  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1786  MutT/nudix family protein  44.06 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1682  SH3-like region  38.46 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00241886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2443  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2704  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0109153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2061  MutT/nudix family protein  43.38 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000668178  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1947  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00431661  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 150 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1639  MutT/NUDIX family NTP pyrophosphohydrolase  36.11 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1561  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1679  NUDIX hydrolase  36.77 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.164244  normal  0.63188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1604  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 163 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1748  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 163 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2631  MutT/nudix family protein  37.86 
 
 		 158 aa  98.2  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1265  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2590  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000106861  normal  0.0536923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1874  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00903017  hitchhiker  0.00000719314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2477  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 162 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000509657  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2470  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000173828  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2062  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 150 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2259  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1721  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2850  NUDIX family hydrolase  39.01 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.482932 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1613  NUDIX family hydrolase  39.01 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2232  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000560671  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3264  NUDIX hydrolase  45.3 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000509473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1647  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.654975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2023  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296194  normal  0.0882034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1943  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.639742  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01132  bifunctional thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase/ thiamin pyrophosphate hydrolase  36.17 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01140  hypothetical protein  36.17 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2513  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00897802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1595  hydrolase, NUDIX family  36.17 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000876504 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1297  NUDIX family hydrolase  36.17 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1991  NUDIX family hydrolase  36.17 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1254  NUDIX family hydrolase  36.17 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440982  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2469  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1870  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0662124  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1312  hydrolase, NUDIX family  35.46 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.869507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2155  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.028212  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1949  hydrolase, NUDIX family  35 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>