More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2664 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  100 
 
 
161 aa  328  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  41.4 
 
 
165 aa  141  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 
147 aa  91.7  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  36.64 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5820  hypothetical protein  34.68 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  36.13 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  36.13 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  36.13 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  33.87 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  36.13 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  36.97 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  35.29 
 
 
147 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  36.13 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  34.45 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  36.73 
 
 
530 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  33.61 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 
305 aa  58.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  30.16 
 
 
159 aa  57.8  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  32.74 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  30.46 
 
 
149 aa  57.4  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  32.28 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  36.63 
 
 
173 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  40 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 
473 aa  54.7  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  29.75 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  31.62 
 
 
132 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
137 aa  54.3  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
209 aa  54.3  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  29.17 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  32.2 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  27.97 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  37.62 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
137 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  34.09 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3008  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 
149 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
141 aa  52.4  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  30.37 
 
 
131 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  32.2 
 
 
131 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 
144 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  38.14 
 
 
131 aa  52.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 
181 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  29.75 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  34.83 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
143 aa  52  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  35.11 
 
 
149 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
149 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 
169 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
149 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  33.72 
 
 
158 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.4 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 
173 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.82 
 
 
128 aa  51.2  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
170 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.82 
 
 
128 aa  51.2  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.82 
 
 
128 aa  51.2  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 
141 aa  50.8  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  40 
 
 
185 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  40 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  40 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  26.72 
 
 
137 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  40 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  40 
 
 
161 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  40 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  40 
 
 
161 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  38.82 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  32.69 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  27.12 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
136 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>