More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7346 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  342  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  50.34 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  32.81 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 184 aa  62  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 141 aa  62  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 		 340 aa  57.8  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  34.87 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  30.83 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  36.63 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  32.86 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  57.78 
 
 		 306 aa  52.4  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 204 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  27.08 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  59.57 
 
 		 144 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 327 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 		 441 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0096  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1808  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 193 aa  51.2  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.801107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 141 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  50.7 
 
 		 210 aa  50.8  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 141 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 141 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  43.37 
 
 		 128 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  28.39 
 
 		 456 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  31.65 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 281 aa  50.1  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  48.48 
 
 		 383 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  50.79 
 
 		 365 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  55.22 
 
 		 221 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 361 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  33.72 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 315 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 299 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  51.56 
 
 		 365 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  51.56 
 
 		 365 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  32.52 
 
 		 132 aa  48.5  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1836  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.41 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466201  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 132 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  39.76 
 
 		 315 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 305 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1769  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.41 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0252  ADP-ribose diphosphatase NudE  47.54 
 
 		 190 aa  47.8  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 164 aa  48.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 255 aa  47.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 		 216 aa  47.8  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  35.29 
 
 		 135 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 146 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  56.52 
 
 		 136 aa  47.8  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  51.92 
 
 		 160 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  51.92 
 
 		 160 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  47.46 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4302  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.93 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  47.46 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1064  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.63 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>