155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3480 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  100 
 
 
151 aa  314  3e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  99.33 
 
 
170 aa  308  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  32 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  33.77 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  27.89 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  26.57 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  28.76 
 
 
204 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  24 
 
 
205 aa  59.7  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
200 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  26.85 
 
 
327 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  31.3 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
340 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  24.53 
 
 
341 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.17 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 
148 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  32.17 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 
441 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 
456 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  36.59 
 
 
351 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 
169 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  27.92 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  39.19 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  43.86 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  43.86 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  28.95 
 
 
173 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  26.72 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  25.81 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  26.83 
 
 
337 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  25.22 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  29.2 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  40.91 
 
 
320 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 
347 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  40 
 
 
147 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
156 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  42 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
142 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  43.4 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  40 
 
 
237 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  39.39 
 
 
320 aa  46.2  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0623  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  26.89 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  32.88 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  40.35 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  34.04 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.38 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  38.71 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  26.06 
 
 
315 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  42.31 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  27.64 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  38.98 
 
 
383 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 
221 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1126  dimethyladenosine transferase  38.98 
 
 
459 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0870793  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  32.04 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  22.88 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  38.46 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  44 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4142  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
390 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  25.69 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  41.07 
 
 
160 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>