91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2117 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 237 aa  471  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  46.1 
 
 		 377 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3223  hypothetical protein  46.56 
 
 		 147 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1129  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 180 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2652  NUDIX hydrolase  47.1 
 
 		 159 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0335859  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 166 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 141 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  28.49 
 
 		 174 aa  49.3  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 179 aa  48.9  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 138 aa  48.5  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 134 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  36.78 
 
 		 134 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 151 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 170 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 155 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 160 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 		 147 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 148 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 		 138 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  38.67 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  36 
 
 		 159 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 148 aa  45.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 156 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 179 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  36.78 
 
 		 134 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 137 aa  45.8  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  32.91 
 
 		 131 aa  45.4  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 147 aa  45.4  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 142 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 441 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 		 151 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 133 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  49.15 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  44.83 
 
 		 141 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  32.41 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  39.77 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 136 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 		 174 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  40.3 
 
 		 149 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  38.03 
 
 		 334 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  50 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  38.03 
 
 		 149 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  40.3 
 
 		 149 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  50 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 341 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 124 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 165 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  40.3 
 
 		 149 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  40.3 
 
 		 149 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  31.25 
 
 		 153 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  35.42 
 
 		 142 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  25.86 
 
 		 135 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  43.94 
 
 		 141 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  26.88 
 
 		 135 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  40.3 
 
 		 149 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 171 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 153 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  23.29 
 
 		 168 aa  42.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 171 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 156 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 146 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 163 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  35.24 
 
 		 158 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 180 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 205 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 176 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 148 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1659  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 194 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.074052  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 176 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 180 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 161 aa  42  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  40.3 
 
 		 149 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 149 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  30.21 
 
 		 159 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 136 aa  41.6  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 171 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 175 aa  41.6  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>