58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2652 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2652  NUDIX hydrolase  100 
 
 
159 aa  313  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0335859  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  47.1 
 
 
237 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3223  hypothetical protein  46.15 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
377 aa  120  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1129  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 
180 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  29.32 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
138 aa  48.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  26.36 
 
 
321 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
131 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
155 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
131 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  32.03 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  30.47 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3302  MutT/Nudix family protein  30.47 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.973400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  32.17 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  34.44 
 
 
205 aa  44.7  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
169 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  37.7 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  37.7 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  28.91 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  30.58 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  38.57 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  28.33 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  30.88 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  31.01 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0467  protein of unknown function DUF344  45.45 
 
 
447 aa  42.4  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  44.26 
 
 
473 aa  42.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
187 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 
160 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  28.85 
 
 
314 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
187 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  27.64 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
151 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  43.4 
 
 
164 aa  41.2  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2193  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52802  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  41.51 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 
187 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
456 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 
187 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  30.23 
 
 
142 aa  40.8  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
340 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
171 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  26.98 
 
 
314 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>