87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3223 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3223  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  291  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2652  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
159 aa  120  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0335859  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 
237 aa  120  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 
377 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1129  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
180 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  30.53 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  30.56 
 
 
158 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  30.56 
 
 
158 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  30.56 
 
 
158 aa  48.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0161  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 
155 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  27.48 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  27.69 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  26.92 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  27.69 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  30 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  34.35 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  45 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.16 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  31.18 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  36.71 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  31 
 
 
157 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3038  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.600491 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  23.31 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  42.37 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  34.78 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  32.61 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  51.06 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  27.69 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  27.69 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  40.68 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  42.59 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  37.5 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 
167 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  42.37 
 
 
145 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.23 
 
 
128 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
145 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
145 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  39.24 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.23 
 
 
128 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.23 
 
 
128 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
179 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  28.48 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0347  (di)nucleoside polyphosphate hydrolase, putative  32.08 
 
 
170 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.163328  normal  0.0864315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  35.77 
 
 
473 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  31 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  31.08 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5820  hypothetical protein  38.16 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  24.62 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  31.01 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
151 aa  40.4  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  33.33 
 
 
329 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  33.33 
 
 
329 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  36.84 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
205 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
142 aa  40  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
162 aa  40  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  30 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
141 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
141 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
141 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
134 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
142 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  32.04 
 
 
141 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>