79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1129 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1129  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 180 aa  353  8.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 377 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2652  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 159 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0335859  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3223  hypothetical protein  43.28 
 
 		 147 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  54.39 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 		 131 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 		 131 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  32.03 
 
 		 131 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3302  MutT/Nudix family protein  30.47 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.973400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 142 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  31.93 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  31.37 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  28.89 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  24.68 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  29.69 
 
 		 129 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  24.68 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 157 aa  45.1  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  24.03 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 169 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  30.16 
 
 		 132 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 148 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  29.82 
 
 		 131 aa  44.3  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 340 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  30.6 
 
 		 131 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  43.96 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  24.2 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  31.78 
 
 		 131 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 341 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 144 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 160 aa  42  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  36.76 
 
 		 160 aa  42  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  35.37 
 
 		 184 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 142 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  39.29 
 
 		 147 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1607  MutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 229 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 164 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 141 aa  41.6  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4737  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 174 aa  41.2  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 180 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 231 aa  41.2  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 151 aa  41.2  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 172 aa  41.2  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 229 aa  40.8  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 166 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 147 aa  40.8  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>