More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1837 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  100 
 
 
158 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  50.83 
 
 
140 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  50 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  50 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  50 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  49.59 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  49.59 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  51.26 
 
 
140 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  52.63 
 
 
132 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  51.26 
 
 
140 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  53.45 
 
 
203 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  52.1 
 
 
141 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  52.1 
 
 
141 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  52.1 
 
 
141 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  51.26 
 
 
141 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  47.5 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 
185 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 
185 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
185 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  44.17 
 
 
122 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 
165 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  48.76 
 
 
135 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
183 aa  97.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  41.67 
 
 
128 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  44.86 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
120 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  35.58 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  38.89 
 
 
758 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  33.04 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  49.15 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  29.25 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
167 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  29.25 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  29.73 
 
 
258 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
229 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  27.05 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  31.52 
 
 
105 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
284 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
156 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
178 aa  51.6  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
303 aa  51.6  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  33.05 
 
 
136 aa  51.2  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  45 
 
 
147 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
181 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  45 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  45 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
172 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  27.07 
 
 
186 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
229 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
430 aa  50.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  44.07 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  31.75 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  30 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 
229 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  43.33 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  32 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 
230 aa  48.9  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 
303 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 
565 aa  48.5  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
252 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  43.33 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  31.62 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
190 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
252 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  43.33 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  43.33 
 
 
147 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>