214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7098 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  100 
 
 
166 aa  335  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  40 
 
 
204 aa  88.6  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  34.03 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 
153 aa  79  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  36.6 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.18 
 
 
340 aa  74.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
456 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  36 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  33.74 
 
 
341 aa  64.3  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  29.14 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  40 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  34.57 
 
 
351 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2117  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
237 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
347 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  37.65 
 
 
173 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  31.34 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 
347 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
141 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
176 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 
166 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
136 aa  51.2  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  36.14 
 
 
176 aa  50.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  30.71 
 
 
172 aa  50.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  36.59 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  36.59 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
172 aa  47.8  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
137 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  42.65 
 
 
136 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  39.02 
 
 
156 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 
164 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  40.91 
 
 
153 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  40.91 
 
 
164 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 
164 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  42.42 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  40.91 
 
 
153 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
187 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
168 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
147 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
142 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 
221 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  38.94 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
320 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  34.94 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.3 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
169 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  54.17 
 
 
221 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
136 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  29.55 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
299 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  29.36 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  45.28 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>