86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0463 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 172 aa  353  6.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  73.84 
 
 		 172 aa  278  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  73.26 
 
 		 172 aa  274  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  62.35 
 
 		 186 aa  244  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  61.63 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  63.95 
 
 		 173 aa  231  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  61.63 
 
 		 176 aa  229  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  59.88 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  58.76 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  58.76 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  58.76 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  61.39 
 
 		 187 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  57.63 
 
 		 178 aa  210  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  58.76 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  58.19 
 
 		 180 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  56.36 
 
 		 182 aa  203  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  55.93 
 
 		 176 aa  200  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  55.93 
 
 		 176 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  55.37 
 
 		 176 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  54.24 
 
 		 176 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  46.82 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  45.66 
 
 		 175 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  37.58 
 
 		 171 aa  94.4  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  36.94 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  27.61 
 
 		 231 aa  52.4  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 314 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  52.38 
 
 		 325 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  26.49 
 
 		 299 aa  48.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 158 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 		 303 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  34.57 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 314 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 237 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 322 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  53.85 
 
 		 317 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3008  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  25.74 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 341 aa  45.1  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 282 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 229 aa  44.7  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  38.89 
 
 		 292 aa  44.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  27.93 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3486  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 351 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 315 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007106  pE33L80004  phosphohydrolase, MutT/Nudix family protein  31.91 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 		 303 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 299 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 310 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 356 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  41.67 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  43.59 
 
 		 343 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  30.49 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  42.4  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4142  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 173 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  25.55 
 
 		 324 aa  42.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  47.92 
 
 		 216 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  46.34 
 
 		 305 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 216 aa  41.6  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 		 241 aa  41.2  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  28.45 
 
 		 148 aa  41.2  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  28.12 
 
 		 237 aa  41.2  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 		 326 aa  41.2  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.74 
 
 		 315 aa  41.2  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  34.69 
 
 		 181 aa  41.2  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 255 aa  40.8  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 150 aa  40.8  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>