53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1812 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  100 
 
 		 205 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  70.93 
 
 		 176 aa  270  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  66.28 
 
 		 172 aa  252  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  62.86 
 
 		 180 aa  249  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  64.53 
 
 		 172 aa  246  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  61.36 
 
 		 180 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  61.63 
 
 		 172 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  60.82 
 
 		 173 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  60.47 
 
 		 186 aa  231  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  58.99 
 
 		 182 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  56.67 
 
 		 178 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  55.14 
 
 		 187 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 176 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  53.98 
 
 		 177 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  52.84 
 
 		 176 aa  187  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  53.41 
 
 		 176 aa  187  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  52.27 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 176 aa  184  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 175 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  36.77 
 
 		 171 aa  92.4  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  36.13 
 
 		 171 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  26.61 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 314 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  47.83 
 
 		 140 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  47.83 
 
 		 140 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  47.83 
 
 		 140 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  47.83 
 
 		 140 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  47.83 
 
 		 140 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 155 aa  45.1  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  47.83 
 
 		 140 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  52.5 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  45.65 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  32.94 
 
 		 148 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  52.5 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  29.07 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 160 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 303 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 146 aa  42.7  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 		 145 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 341 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 356 aa  41.6  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 237 aa  41.2  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 173 aa  41.2  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  24.81 
 
 		 166 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>