226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0760 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 182 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  71.02 
 
 		 187 aa  276  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  58.99 
 
 		 205 aa  220  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  64.52 
 
 		 176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  59.22 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  55.11 
 
 		 172 aa  210  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  57.06 
 
 		 178 aa  207  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  57.95 
 
 		 173 aa  207  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  56.5 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  56.79 
 
 		 186 aa  204  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  56.36 
 
 		 172 aa  203  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  52.84 
 
 		 172 aa  202  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  59.12 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  57.83 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  57.83 
 
 		 180 aa  184  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  57.83 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  57.83 
 
 		 176 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  53.14 
 
 		 176 aa  178  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  53.71 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  53.14 
 
 		 176 aa  177  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  52.57 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  47.4 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 		 177 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  35.03 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  34.39 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  30.51 
 
 		 231 aa  52  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  28.81 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 122 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  33.09 
 
 		 148 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 136 aa  48.1  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 158 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  32.59 
 
 		 148 aa  47.8  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  44.44 
 
 		 148 aa  47.8  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  49.06 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  54.17 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 341 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  32.59 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  27.04 
 
 		 299 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  46.94 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  46.94 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  32.43 
 
 		 269 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  44.9 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  27.5 
 
 		 314 aa  45.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  45.24 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  45.24 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  45.24 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  45.24 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  45.24 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  47.5 
 
 		 140 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  41.43 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 155 aa  44.7  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 146 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 140 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 356 aa  44.7  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  30.58 
 
 		 148 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 185 aa  44.3  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  43.75 
 
 		 173 aa  44.3  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  27.35 
 
 		 336 aa  44.3  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.75 
 
 		 193 aa  44.3  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.75 
 
 		 172 aa  44.3  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  24.49 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  24.3 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  25.51 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  38.1 
 
 		 321 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  24.49 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  25.51 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  48.84 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  31.4 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.18 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  48.72 
 
 		 317 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1888  mutT/nudix family protein  27.07 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0131213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>