148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2236 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 356 aa  719    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  55.65 
 
 		 343 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 		 324 aa  300  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  47.26 
 
 		 326 aa  281  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  42.2 
 
 		 314 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  42.81 
 
 		 322 aa  233  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  43.54 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  39.29 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  31.52 
 
 		 398 aa  196  5.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  39.07 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  36.33 
 
 		 292 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 		 333 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  29.97 
 
 		 395 aa  159  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  36.79 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  33.09 
 
 		 305 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  34.6 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  33.22 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  31.9 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 314 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  31.66 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 322 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  29.45 
 
 		 301 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.62 
 
 		 577 aa  66.6  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 139 aa  62.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  36.88 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  26.87 
 
 		 136 aa  53.1  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 144 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 150 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 147 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 139 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 		 583 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 140 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  32.52 
 
 		 137 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 156 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 155 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 155 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 155 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  27.89 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 137 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 155 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 155 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 155 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  33.63 
 
 		 160 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 146 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 153 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 194 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 158 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 161 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 156 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  35 
 
 		 229 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 208 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 195 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 180 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 143 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 129 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 		 142 aa  47  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 137 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 150 aa  46.6  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  36.25 
 
 		 153 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 229 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 139 aa  46.2  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  36.25 
 
 		 153 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  36.25 
 
 		 153 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  36.25 
 
 		 153 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  36.25 
 
 		 153 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 167 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 187 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  32.89 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 152 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  36.25 
 
 		 153 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  36.25 
 
 		 153 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3516  phosphohydrolase  31.97 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  36.25 
 
 		 153 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  34.34 
 
 		 140 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  27.52 
 
 		 147 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  23.33 
 
 		 185 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1826  phosphohydrolase  34.41 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5237  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  34.34 
 
 		 140 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>