290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1197 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 216 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  68.69 
 
 		 211 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  67.33 
 
 		 195 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  73.08 
 
 		 180 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  65.49 
 
 		 322 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 303 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  36.76 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 314 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  39.66 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  35.29 
 
 		 292 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  33.99 
 
 		 314 aa  64.7  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  37.59 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  34.88 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 315 aa  61.6  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 322 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 150 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1831  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2173  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.573949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  34.92 
 
 		 336 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 149 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 139 aa  53.1  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 158 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 140 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  40.7 
 
 		 343 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  36.36 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  31.45 
 
 		 169 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  37.37 
 
 		 430 aa  52  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 270 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 270 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 270 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 182 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 282 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  35.82 
 
 		 536 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 141 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  34.82 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 141 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.08 
 
 		 315 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  29.77 
 
 		 395 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 129 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2704  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0109153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  25.78 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.75 
 
 		 128 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.75 
 
 		 128 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 281 aa  49.3  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.75 
 
 		 128 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 137 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 152 aa  49.3  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  31.93 
 
 		 155 aa  48.9  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  32.03 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 150 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  37.78 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  36.67 
 
 		 308 aa  48.5  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 141 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 356 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 333 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  25.81 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 168 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>