More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4264 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  100 
 
 
286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
324 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  42.33 
 
 
314 aa  190  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 
303 aa  185  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  39.45 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  42.91 
 
 
343 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  39.62 
 
 
336 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  40.07 
 
 
351 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
322 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 
333 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  39 
 
 
305 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 
299 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  36.68 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  39.34 
 
 
308 aa  166  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 
311 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 
311 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 
302 aa  162  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 
315 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
356 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 
303 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 
341 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  34 
 
 
317 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  37.46 
 
 
325 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  37.58 
 
 
301 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  40.55 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.64 
 
 
315 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  35 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  32.21 
 
 
395 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  28.84 
 
 
398 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 
139 aa  73.9  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  40 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
140 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 
146 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  46.84 
 
 
137 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
140 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
211 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 
136 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
229 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
229 aa  58.9  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.89 
 
 
577 aa  58.5  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  32.06 
 
 
142 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
129 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
161 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  36.67 
 
 
153 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
139 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 
155 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
180 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  36.67 
 
 
153 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  36.67 
 
 
153 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
143 aa  55.8  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  36.67 
 
 
153 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
139 aa  55.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  35.56 
 
 
153 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  35.56 
 
 
153 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  35.56 
 
 
153 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  52.46 
 
 
147 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  35.56 
 
 
153 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
208 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 
166 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 
142 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
153 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  35.56 
 
 
229 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0749  NUDIX family hydrolase  29.63 
 
 
164 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.159748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0736  NUDIX domain-containing protein  29.63 
 
 
164 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  49.06 
 
 
160 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
174 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
158 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.06 
 
 
583 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 
140 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
144 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
147 aa  53.1  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
167 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  28.78 
 
 
139 aa  52.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 
143 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
148 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
133 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
145 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
144 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
141 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0516  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
171 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 
153 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  36.04 
 
 
141 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  47.17 
 
 
160 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
164 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 
152 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  47.17 
 
 
160 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>