More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0736 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0749  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 164 aa  334  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.159748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0736  NUDIX domain-containing protein  100 
 
 		 164 aa  334  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0561  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0575  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 286 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  32.72 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19860  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  32.92 
 
 		 279 aa  80.9  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  28 
 
 		 303 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  27.45 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  29.38 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  26.11 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 341 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  31.37 
 
 		 289 aa  74.7  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 		 281 aa  73.9  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  26.92 
 
 		 269 aa  73.9  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  26.14 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2476  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  27.84 
 
 		 276 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  29.63 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  24.5 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  25.47 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  26.71 
 
 		 278 aa  68.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  29.11 
 
 		 271 aa  68.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  28.38 
 
 		 325 aa  67.4  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  26.49 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3595  MutT/nudix family protein  25.64 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000478506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  24.68 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2754  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  25.79 
 
 		 319 aa  64.7  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  27.03 
 
 		 327 aa  64.3  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0831  NUDIX hydrolase  24.56 
 
 		 358 aa  64.3  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.809645  normal  0.125319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0865  NUDIX hydrolase  23.95 
 
 		 319 aa  63.9  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 305 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  25.76 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  23.36 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16157  predicted protein  30.82 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  22.67 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  27.66 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  25.71 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  29.06 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  25.71 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  25.71 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  27.1 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  25.71 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  25.18 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  25.71 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  25.71 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  25.71 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  23.57 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  30.91 
 
 		 313 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4961  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 		 314 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  27.35 
 
 		 257 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  26.57 
 
 		 310 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  24 
 
 		 306 aa  62  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  25.79 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  25.69 
 
 		 310 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  28.66 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1407  NADH pyrophosphatase  31.82 
 
 		 311 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1425  NADH pyrophosphatase  31.82 
 
 		 311 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  29.57 
 
 		 310 aa  61.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1461  NADH pyrophosphatase  31.82 
 
 		 311 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  25 
 
 		 257 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  28.26 
 
 		 321 aa  60.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  22.58 
 
 		 260 aa  60.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4662  NADH pyrophosphatase  33.03 
 
 		 308 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836669  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1805  NADH pyrophosphatase  30.91 
 
 		 308 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106205  normal  0.106222 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  23.57 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2908  NUDIX hydrolase  25.17 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0382246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  26.5 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  24.29 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  24.29 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  26.5 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  26.5 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  23.57 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  24.67 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  26.95 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  26.17 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4850  NUDIX hydrolase  26.43 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.716993  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  26.42 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4447  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.77195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  24.67 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  25.64 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  24.5 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>