217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0561 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0561  NUDIX family hydrolase  100 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0575  NUDIX family hydrolase  98.88 
 
 		 179 aa  358  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0749  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.159748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0736  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002176  NADH pyrophosphatase  32.1 
 
 		 265 aa  92.8  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  29.63 
 
 		 269 aa  90.5  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  31.33 
 
 		 269 aa  88.6  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 294 aa  88.2  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  33.33 
 
 		 260 aa  87.8  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3223  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 273 aa  86.3  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  33.13 
 
 		 289 aa  84.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2453  NADH pyrophosphatase  28.93 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0512372  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2720  mutT/nudix family protein  28.3 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.897889  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  30.07 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4444  NADH pyrophosphatase  31.01 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00022732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03873  NADH pyrophosphatase  30.38 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3998  NUDIX hydrolase  30.38 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4487  NADH pyrophosphatase  30.38 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4539  NADH pyrophosphatase  30.38 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03826  hypothetical protein  30.38 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4230  NADH pyrophosphatase  30.38 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4029  NADH pyrophosphatase  30.38 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1044  mutT/nudix family protein  29.03 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5465  NADH pyrophosphatase  30.38 
 
 		 257 aa  78.2  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.655268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4497  NADH pyrophosphatase  30.38 
 
 		 257 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0213406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 278 aa  78.2  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4410  NADH pyrophosphatase  30.38 
 
 		 257 aa  78.2  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.172037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 288 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4573  NADH pyrophosphatase  30.38 
 
 		 257 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.117835 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 		 261 aa  77.8  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4499  NADH pyrophosphatase  30.38 
 
 		 257 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461248  hitchhiker  0.000431337 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0457  NADH pyrophosphatase  25.48 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3851  NADH pyrophosphatase  25.48 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0349  NADH pyrophosphatase  25.48 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389702  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4377  NADH pyrophosphatase  29.75 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  28.48 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0218  NADH pyrophosphatase  27.22 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0286  NADH pyrophosphatase  25.97 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  38 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0209  NADH pyrophosphatase  32.08 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0313509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2427  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 		 301 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 298 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3868  NADH pyrophosphatase  26.58 
 
 		 257 aa  74.7  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  27.85 
 
 		 260 aa  74.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0415  NTP pyrophosphohydrolase  29.38 
 
 		 289 aa  74.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.362153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  40.23 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 261 aa  72  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02952  NADH pyrophosphatase  29.93 
 
 		 308 aa  72  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3714  NADH pyrophosphatase  28.93 
 
 		 257 aa  71.6  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.506766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  31.03 
 
 		 283 aa  71.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 		 286 aa  70.9  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27580  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  28.99 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  28.22 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  27.04 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  25.62 
 
 		 271 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4029  NADH pyrophosphatase  31.16 
 
 		 276 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.459917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1842  NADH pyrophosphatase  31.16 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0229622 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1809  NADH pyrophosphatase  30.43 
 
 		 276 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00640  NUDIX family pyrophosphohydrolase containing a Zn-finger  29.81 
 
 		 277 aa  62  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3628  NADH pyrophosphatase  29.71 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  28.06 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19860  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  27.5 
 
 		 279 aa  61.2  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.526889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0205  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  29.79 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  26.09 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  25.17 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1137  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.217943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  25.68 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40950  NADH pyrophosphatase  30.52 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  27.22 
 
 		 303 aa  57.8  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3472  NADH pyrophosphatase  30.52 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0985  NTP pyrophosphohydrolase  24 
 
 		 430 aa  57  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0811377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  26.87 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0617  NUDIX hydrolase  26.24 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.348665  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2001  NUDIX hydrolase  27.91 
 
 		 303 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  24.84 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15070  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  25.29 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  24.54 
 
 		 382 aa  55.1  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1176  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.08579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  25.93 
 
 		 341 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0089  NUDIX hydrolase  27.03 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0736249 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0853  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 		 351 aa  55.1  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 		 331 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  29.91 
 
 		 326 aa  54.3  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3868  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 327 aa  54.3  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.558102  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  31.19 
 
 		 313 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0670  NUDIX hydrolase  26.35 
 
 		 310 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.479149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  24.83 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3316  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 		 323 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  25.9 
 
 		 327 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2476  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 		 352 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>