119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4501 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 322 aa  633  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  43.99 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  43.92 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  43.92 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  43.92 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  41.72 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  42.91 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 		 301 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.6 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  39.25 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  39.81 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  39.93 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  45.39 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  42.91 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  39.29 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  43.13 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  38.18 
 
 		 301 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 289 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  40.93 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 286 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  35.43 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  36.01 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  35.62 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 351 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  34.7 
 
 		 336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  29.26 
 
 		 395 aa  99.4  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  25.25 
 
 		 398 aa  96.7  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  42.14 
 
 		 139 aa  71.6  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  37.32 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  34.35 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  24.67 
 
 		 577 aa  63.2  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 149 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  35.81 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 166 aa  57  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 158 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 141 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 139 aa  53.5  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 153 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 147 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 146 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 140 aa  52  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  37.23 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 143 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 138 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 174 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  36.13 
 
 		 424 aa  50.8  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 		 139 aa  50.4  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  25.55 
 
 		 229 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  31.45 
 
 		 169 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 270 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 143 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 219 aa  49.7  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 143 aa  49.3  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 141 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 153 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 142 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  27.46 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  29.19 
 
 		 205 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  27.93 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 144 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 151 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 207 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  27.34 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 134 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 144 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 174 aa  46.6  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 142 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 182 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 164 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>