More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0927 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  100 
 
 
129 aa  260  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  69.17 
 
 
137 aa  174  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
536 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  45.98 
 
 
424 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  34.09 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  32 
 
 
351 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
322 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
174 aa  63.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  35.45 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 
194 aa  62.8  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  35 
 
 
229 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
268 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
208 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
151 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
270 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
270 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
270 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0179  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0431401  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
282 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  38.71 
 
 
248 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1443  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  36.17 
 
 
208 aa  59.7  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  32.95 
 
 
430 aa  58.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  34.48 
 
 
258 aa  58.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
229 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
289 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
272 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
190 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
158 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
158 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 
311 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 
311 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
174 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 
311 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  32.73 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
182 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  44.05 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  34.43 
 
 
292 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
341 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  42.86 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  29.85 
 
 
325 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  35.87 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
296 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 
207 aa  53.9  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
174 aa  53.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 
333 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
134 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
315 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  26.56 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
187 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
187 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  26.56 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  26.56 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  32.65 
 
 
308 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  43.04 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  50 
 
 
229 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
310 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
141 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  45.76 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  50 
 
 
153 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
166 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>