148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03520 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 308 aa  613  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  49.08 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  43.54 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  40.51 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  40.38 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  40.53 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  39.27 
 
 		 351 aa  195  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  39.67 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  41.92 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  42.69 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  40.93 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  29.76 
 
 		 398 aa  158  9e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  36.06 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  37.76 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 299 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  37.54 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  30.99 
 
 		 395 aa  145  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 314 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 333 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.21 
 
 		 315 aa  122  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  32.09 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.52 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 164 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 137 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  36.51 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 149 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 141 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 		 144 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  27.46 
 
 		 149 aa  54.7  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 140 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 174 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 129 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  33.96 
 
 		 169 aa  52.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  33.04 
 
 		 140 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 141 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 148 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 154 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 144 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 142 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 150 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  28.7 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  31.68 
 
 		 140 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 174 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 154 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.23 
 
 		 577 aa  50.1  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  32.17 
 
 		 140 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 140 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  31.58 
 
 		 140 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 140 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  30.12 
 
 		 139 aa  50.1  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 155 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 229 aa  49.3  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 180 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 216 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 145 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 158 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  32.14 
 
 		 139 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 195 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 139 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  29.7 
 
 		 140 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  31 
 
 		 141 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  31 
 
 		 147 aa  47  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 138 aa  46.6  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 154 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  28.71 
 
 		 140 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 140 aa  46.2  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 216 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 205 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  26.87 
 
 		 142 aa  46.2  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  30.94 
 
 		 203 aa  46.2  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  28.71 
 
 		 140 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  29.31 
 
 		 430 aa  45.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  38.16 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 		 149 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  34.58 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.68 
 
 		 133 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  35.44 
 
 		 148 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>