250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13000 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  100 
 
 
317 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  70.17 
 
 
310 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  69.15 
 
 
299 aa  407  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  67.87 
 
 
311 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  67.21 
 
 
311 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  67.21 
 
 
311 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  53.02 
 
 
302 aa  295  7e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  49.84 
 
 
315 aa  277  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  46.73 
 
 
305 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  46.53 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  41.3 
 
 
292 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 
322 aa  195  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  41.69 
 
 
303 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  40.46 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  42.01 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  37.54 
 
 
333 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  35.81 
 
 
301 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  37.02 
 
 
314 aa  155  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
356 aa  155  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  36.06 
 
 
308 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  38.43 
 
 
296 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
289 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  35.93 
 
 
343 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  35.52 
 
 
351 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
326 aa  133  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  36.02 
 
 
336 aa  132  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
286 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
322 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  33.61 
 
 
395 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  34.63 
 
 
333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  29.53 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  37.55 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
140 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
149 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  41.41 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  38.68 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
211 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  34.31 
 
 
430 aa  66.6  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  34.31 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
147 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
180 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
270 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
216 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  39.58 
 
 
248 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
174 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
229 aa  63.2  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
195 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
140 aa  62.4  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 
139 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  33.57 
 
 
160 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
143 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
166 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
219 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
182 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
147 aa  59.7  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
203 aa  58.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
151 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
145 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
158 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
139 aa  57.4  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
143 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
141 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
146 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  36 
 
 
206 aa  56.2  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
237 aa  55.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  35 
 
 
205 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 
158 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
158 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 
142 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.06 
 
 
159 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 
143 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  35 
 
 
182 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  38.75 
 
 
195 aa  53.5  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
139 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
137 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
147 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
153 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
147 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
166 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
208 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 
230 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
161 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
153 aa  50.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
158 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  34.58 
 
 
234 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  35.29 
 
 
234 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>