93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2816 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  100 
 
 
326 aa  620  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  57.68 
 
 
324 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  57.78 
 
 
343 aa  315  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  47.26 
 
 
356 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 
341 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  44.65 
 
 
351 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  45.14 
 
 
322 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  46.39 
 
 
314 aa  242  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  49.08 
 
 
308 aa  228  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  43.22 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  44.22 
 
 
303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
286 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  30.68 
 
 
398 aa  151  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 
303 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  38.83 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  35.79 
 
 
305 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
322 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  35.19 
 
 
317 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 
301 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  30.79 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  38.55 
 
 
325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 
314 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  37.15 
 
 
333 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
296 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 
289 aa  122  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
299 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  34.89 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
315 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.58 
 
 
315 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
139 aa  63.5  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 
149 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
211 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
195 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
216 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
164 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
155 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 
150 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 
136 aa  53.5  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
161 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 
139 aa  52.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 
205 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 
140 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  27.27 
 
 
142 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  25.37 
 
 
149 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  25.9 
 
 
577 aa  50.8  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  41.76 
 
 
322 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  28.08 
 
 
229 aa  49.3  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
161 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  41.49 
 
 
424 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
143 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
146 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
144 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  44.58 
 
 
154 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
151 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  40 
 
 
140 aa  47  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
137 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
164 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
180 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  37.36 
 
 
145 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.92 
 
 
583 aa  46.6  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  28.78 
 
 
172 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
138 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
151 aa  46.2  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
154 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4015  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.71 
 
 
134 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  35.71 
 
 
167 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.22 
 
 
160 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  40 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  30.59 
 
 
128 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
147 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  39.02 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  39.02 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
206 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.23 
 
 
134 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
144 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
138 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
166 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
151 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  37.04 
 
 
203 aa  42.7  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
130 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  28.21 
 
 
153 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
139 aa  42.7  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
302 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
154 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 
229 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>