94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5719 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 154 aa  309  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  85.53 
 
 		 154 aa  267  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  60.4 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  59.18 
 
 		 155 aa  170  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  55.41 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  55.1 
 
 		 152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  54.3 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  52.35 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  54.36 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  50.67 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 		 162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  51.63 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  47.33 
 
 		 172 aa  141  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  53.06 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  50.66 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  53.69 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  54.11 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  45.58 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  53.42 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  48.99 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  48.41 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  47.53 
 
 		 324 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  51.27 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  48 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  49.7 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  53.25 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 154 aa  126  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  35.1 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 296 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 289 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 333 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  32.52 
 
 		 308 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 303 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1415  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 341 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  46.15 
 
 		 473 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5916  ADP-ribose diphosphatase NudE  63.89 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  31.54 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  31.54 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68380  ADP-ribose diphosphatase NudE  63.89 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000374463  normal  0.555558 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2661  ADP-ribose diphosphatase NudE  51.06 
 
 		 211 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283798  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  30.47 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 320 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0285  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.33 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05490  ADP-ribose diphosphatase NudE  48.98 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00271926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0284  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.33 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  33.64 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4950  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.33 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  33.04 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  33.04 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  33.04 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  33.04 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  42.05 
 
 		 314 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  31.39 
 
 		 325 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 326 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  31.9 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0275  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.33 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0260  ADP-ribose diphosphatase NudE  58.33 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0135852 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  37.33 
 
 		 224 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  28.39 
 
 		 234 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.64 
 
 		 170 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  38.16 
 
 		 292 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  39.34 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  25.66 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  27.89 
 
 		 305 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4941  ADP-ribose diphosphatase NudE  55.56 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  35.42 
 
 		 336 aa  41.2  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 174 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 351 aa  41.2  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0393  ADP-ribose diphosphatase NudE  52.78 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  37.35 
 
 		 343 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 248 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>