52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3182 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  100 
 
 
163 aa  322  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  80.37 
 
 
163 aa  258  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  73.55 
 
 
157 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  73.55 
 
 
157 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  73.55 
 
 
157 aa  226  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  66.89 
 
 
166 aa  206  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  60.26 
 
 
154 aa  180  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  58.55 
 
 
155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  61.81 
 
 
154 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  55.21 
 
 
163 aa  169  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  59.59 
 
 
152 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 
160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  59.86 
 
 
174 aa  160  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  56.08 
 
 
153 aa  159  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  56.44 
 
 
168 aa  159  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  55.35 
 
 
162 aa  159  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 
153 aa  158  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 
160 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 
155 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  54.79 
 
 
155 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 
162 aa  148  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  58.06 
 
 
154 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
154 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 
155 aa  146  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  49.33 
 
 
164 aa  141  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  48.65 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  54.11 
 
 
154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  51.55 
 
 
165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  52.47 
 
 
324 aa  137  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 
154 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  48.17 
 
 
166 aa  127  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  44.52 
 
 
154 aa  117  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 
229 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  34 
 
 
324 aa  48.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
289 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  29.8 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
333 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
167 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
301 aa  41.6  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  45.16 
 
 
343 aa  41.6  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
230 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
172 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  29.41 
 
 
325 aa  41.2  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
165 aa  40.4  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
302 aa  40.4  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>